商纣王往女娲宫进香,见殿中圣像,在粉壁上题下轻薄诗句。女娲回宫看见题诗,召来轩辕坟三妖,命她们隐去妖形、托身宫院,惑乱纣王心志。
千年狐精在恩州驿途中害死苏护之女妲己,借她身躯进入朝歌。纣王日益沉湎酒色,朝中先后设炮烙、虿盆等酷刑,梅伯、比干等人死去,黄飞虎也反出朝歌。
姜子牙在昆仑山学道四十年,元始天尊命他下山辅佐明主、代理封神。他先在朝歌为官,后从都城逃走,到渭水畔等候西伯侯姬昌。
姬昌将姜子牙迎回西岐,任为丞相。姬昌死后,姬发继位;张桂芳、魔家四将等商朝将领先后攻打西岐,哪吒、杨戬与其他阐教门人则陆续入周营出战。
闻仲亲率大军西征,又请十天君在西岐城外摆下十绝阵。姚宾在落魂阵中拜走姜子牙魂魄,赤精子借太极图抢回草人;阐教金仙随后逐阵交战,十阵相继被破。
赵公明带定海神珠下山助商,连伤阐教众人,后被陆压以钉头七箭书拜死。云霄、琼霄、碧霄为兄报仇,摆下九曲黄河阵,以混元金斗收去十二金仙与多名周将。
老子与元始来到阵前,收住混元金斗,破开黄河阵。云霄被乾坤图裹走、压向麒麟崖,琼霄、碧霄死于阵前,被困门人才得脱身。
闻仲收拢残军退走,在绝龙岭被云中子以通天神火柱困住,最后死于火中。其后邓九公、洪锦等人先后归周,姜子牙整军东进,连过数关。
广成子在佳梦关打死火灵圣母,带金霞冠三次进入碧游宫归还。截教门人在宫外追赶广成子,两教冲突遂直达通天座前。
通天命多宝在界牌关摆下诛仙阵。老子、元始、接引、准提分从四门入阵,广成子、赤精子、玉鼎真人、道行天尊趁隙摘下四剑,诛仙阵随之破开。
通天随后又集结门下,摆成万仙阵。金灵圣母与许多截教仙人战死,无当圣母离阵,长耳定光仙携六魂幡投向芦篷,接引以乾坤袋收走三千红气之客。
万仙阵破后,鸿钧来到三清面前,命他们各服一粒丹药,不得再起相攻之心,随后带通天离开。姜子牙继续行军,与诸侯兵会于孟津。
周军攻入朝歌,纣王登摘星楼自焚。轩辕坟三妖逃离都城时被女娲拦住,又被杨戬、雷震子等人押回周营,姜子牙在辕门将三妖处斩。
商朝既亡,姜子牙得元始敕命,登岐山封神台宣读封神榜。柏鉴依次引闻仲、赵公明、三霄、十天君与各路阵亡者上台,三百六十五位正神各受职司。